Древние бактерии кишечника исчезают у современных людей
Микробы сопровождали человека тысячелетиями, но индустриальный образ жизни оставляет от этого наследия всё меньше.
Исследование опубликовано 7 октября в Nature. Авторы провели глубокое метагеномное секвенирование образцов цимане и сопоставили их с ранее собранными данными хадза — охотников-собирателей, живущих на другом континенте. Предки этих двух народов разошлись десятки тысяч лет назад.
Тем удивительнее совпадение. У хадза и цимане нашли 1231 общий микробный вид. Для 636 из них исследователи смогли восстановить популяционную историю. Генетические расхождения многих бактерий приблизительно совпали по времени с древними миграциями людей из Африки и позднейшим заселением Америки.
«Сотни бактериальных видов были нашими древними спутниками», — говорит старший автор работы, микробиолог Стэнфорда Джастин Зонненбург. По его словам, они, вероятно, передавались от поколения к поколению на протяжении тысячелетий.
Но у современного человека значительная часть этого наследия исчезает. Около 60% видов, общих для хадза и цимане, сегодня редки или вовсе не обнаруживаются в микробиоме жителей индустриальных обществ. Многие относятся к группе VANISH — так авторы называют микроорганизмы, которые становятся менее распространёнными по мере урбанизации и модернизации.
Причина не сводится к одному фактору. Предыдущие работы связывают изменение микробиома с антибиотиками, рационом с низким содержанием клетчатки и большим количеством переработанной пищи, а также с более санитарной средой. Это полезные достижения цивилизации, но для части кишечных микроорганизмов новая среда может оказаться непривычной.
Важно, что исследование не доказывает: исчезновение конкретной бактерии обязательно вызывает конкретную болезнь. Авторы прямо пишут, что последствия этой утраты для здоровья пока неизвестны. Связи между изменённым микробиомом и хроническими воспалительными или метаболическими заболеваниями изучаются, но причинность здесь значительно сложнее.
Физик Бенджамин Гуд, анализировавший эволюцию бактерий, сформулировал вывод осторожно: «Мы видим признаки того, что эти бактерии были у общих предков хадза и цимане». То есть исследователи увидели не случайный набор микробов традиционных обществ, а след очень старого соседства человека и бактерий.
Это согласуется с работой 2021 года: микробные геномы из человеческих палеофекалий возрастом 1000–2000 лет оказались ближе к современным неиндустриальным микробиомам, чем к микробиому жителей развитых стран. Новая работа отодвигает эту историю намного глубже — к эпохе древних миграций человечества.
Мы привыкли считать прогресс исключительно историей приобретений. Микробиом показывает другую сторону: за несколько поколений человек мог потерять часть микроскопических спутников, с которыми его организм сосуществовал десятки тысяч лет.
Фото: редакция ИЗНАНКИ.
